关于斯里兰卡自然动植物遗传多样性的资料极其有限。斯里兰卡的本土植物遗传资源位于该国的自然生态系统和多样化的农业系统中。自然菌群的遗传多样性是记录最少的部分。几乎所有可用信息都局限于具有重要经济意义的农作物及其野生近亲。

对豹子的遗传多样性进行的研究表明，与马来西亚半岛相比，斯里兰卡人群的遗传变异较低。分子分析表明，斯里兰卡豹是一个独特的亚种，是世界上十个亚种之一。在斯里兰卡大象中，观察到该岛北部、中纬度和南部地区之间的线粒体DNA分化水平相对较高。
最近的分子分析表明，直接发育的Philautus属（Rhacophoridae）的树蛙是一种大规模的特有岛屿辐射。分子系统发育研究还表明，斯里兰卡的凯西里安动物群是单系起源的，即西南低地的动物群由进化枝组成，可能与中部高地的差异相对较新。

在这些植物中，已经对Dipterocarpaceae（Shorea和特有属Stemonoporus）、Myrtaceae135（Syzygium spp.）和Annonaceae（Polyalthia spp. 和 Xylopia 冠军）的某些成员进行了系统发育和种群遗传学研究。事实证明，由于较高的外交率，一些Dipterocarp物种群在总遗传多样性中所占的比例与热带木本物种文献中报告的平均水平相似。据报道，在记录的森林碎片中，这些物种的种群内遗传变异较低，这表明森林退化、分散化和栖息地规模缩小导致了它们的遗传侵蚀。

正在对野生近亲、传统品种和陆地品种的遗传多样性进行估计，以便在保护区内外、农田和家庭菜园、适当的基因库进行原地和异地保护，并主要通过农业和出口农业部和种植园作物研究所的举措进行表征。该岛不同农业生态区域的作物遗传资源的多样性相当高。佩拉德尼亚的国家植物标本馆已对斯里兰卡大约645种作物野生亲缘物种进行了分类。

岛上的农业植物多样性包括具有2,800个品种/陆地种族和五种野生亲缘植物的水稻（水稻）、7种粗粮物种及其传统的玉米和高粱品种；14种谷物豆科植物；8种葫芦科植物、2种茄科蔬菜和4种其他蔬菜（豆类、秋葵、苋菜、辣椒）；17种根类和块茎作物。经济实用的香料是 8 种肉桂、Elettaria cardamomum、3 种 Piper 物种（有 7 种野生亲属）、丁香、肉豆蔻、槟栗、香草、辣椒和生姜。其他重要的饮料包括三种主要饮料（茶、咖啡和可可）、甘蔗、kitul plam、槟梨、罗望子、香茅、3种油类作物和两种纤维作物。园艺品种包括具有九个品种和两个野生亲缘品种的香蕉、柑橘和其他20多种水果物种。这些种类繁多的农作物的种质存放在农业部的种子基因库和田间基因库中，也保存在异地的乡村家庭花园中。

总共有1414种斯里兰卡植物被认为对本土（阿育吠陀）医学具有价值。其中50种是大量使用的，208种是常用的，79种受到威胁。已经开展了一个项目，为斯里兰卡药用植物的保护和可持续利用奠定基础。

PGRC 按作物组划分的种质收集状况

作物组	PGRC 的加入 人数
水稻及相关物种	4999
其他谷物和相关物种	1788
谷物豆类	2221
蔬菜（豆类、葫芦、甘蓝、大葱、多叶蔬菜等 ）	3164
Solanacious 蔬菜和调味品	1387
水果作物	165
根茎和块茎作物*	200
石油作物	442
药用植物	30
纤维作物	67
芥末和相关香料	134