La información sobre la diversidad genética de la flora y fauna naturales de Sri Lanka es extremadamente limitada. Los recursos fitogenéticos autóctonos de Sri Lanka residen en los ecosistemas naturales y en los diversos sistemas agrícolas del país. La diversidad genética de la flora natural es el segmento menos documentado. Casi toda la información disponible se limita a los cultivos agrícolas de importancia económica y a sus parientes silvestres.

Los estudios realizados sobre la diversidad genética de los leopardos indican una menor variación genética en las poblaciones de Sri Lanka en comparación con las de Malasia peninsular. Los análisis moleculares han demostrado que el leopardo de Sri Lanka es una subespecie distinta, una de las diez del mundo. Entre los elefantes de Sri Lanka, se observaron niveles relativamente altos de diferenciación en el ADN mitocondrial entre las regiones del norte, de latitudes medias y del sur de la isla.
Análisis moleculares recientes han demostrado que las ranas arborícolas del género Philautus (Rhacophoridae), que se desarrollan directamente, representan una gran radiación insular endémica. Los estudios filogenéticos moleculares también han demostrado que la fauna de cecilias de Sri Lanka es de origen monofilético y que las de las tierras bajas sudoccidentales forman un clado, lo que posiblemente represente una divergencia relativamente reciente con respecto a las de las tierras altas centrales.

Entre las plantas, se han realizado estudios filogenéticos y genéticos poblacionales en algunos miembros de Dipterocarpaceae (Shorea y el género endémico Stemonoporus), Myrtaceae135 (Syzygium spp.) y Annonaceae (Polyalthia spp. y Xylopia champion). Se ha demostrado que la proporción de la diversidad genética total entre las poblaciones de algunas de las especies de dípterocarpos resultante de tasas más altas de cruzamiento es similar al promedio reportado en la literatura para las especies leñosas tropicales. Se ha registrado una menor variación genética dentro de la población de estas especies en los fragmentos de bosque talados, lo que sugiere que la degradación de los bosques, la fragmentación y la reducción del tamaño del hábitat han provocado su erosión genética.

La diversidad genética de los parientes silvestres, los cultivares tradicionales y las razas terrestres de las especies de cultivos se está estimando para su conservación tanto in situ como ex situ, tanto dentro como fuera de las áreas protegidas, en las tierras de cultivo y huertos familiares y en los bancos de genes, cuando proceda, y se caracteriza principalmente mediante las iniciativas de los Departamentos de Agricultura y Agricultura de Exportación y de los Institutos de Investigación de Cultivos de Plantación. La diversidad de los recursos fitogenéticos en las diferentes regiones agroecológicas de la isla es bastante alta. En el Herbario Nacional de Peradeniya se han catalogado unas 645 especies de parientes silvestres de los cultivos parientes de Sri Lanka.

La diversidad de plantas agrícolas en la isla incluye Oryza sativa (arroz) con sus 2.800 variedades/razas terrestres y cinco parientes silvestres, 7 especies de granos gruesos y sus cultivares tradicionales de maíz y sorgo; 14 especies de leguminosas de grano; 8 especies de cucurbitáceas, 2 solonáceas y 4 de otros vegetales (frijol, okra, amaranto, chile); 17 especies de tubérculos y raíces. Las especias económicamente útiles son 8 especies de canela, Elettaria cardamomum, 3 especies de gaiteros (con 7 parientes silvestres), clavo, nuez moscada, nuez de betel, vainilla, guindilla y jengibre. Otras especies importantes son las tres principales especies de bebidas (té, café y cacao): la caña de azúcar, la palma kitul, el cacahuete, el tamarindo, la citronela, 3 especies de oleaginosas y 2 de fibras. Las especies hortícolas incluyen el banano, con nueve cultivares y dos parientes silvestres, los cítricos y más de 20 especies frutales más. Las accesiones al germoplasma de esta amplia gama de cultivos se guardan en el banco de genes de semillas y en los bancos de genes de campo del Departamento de Agricultura y también ex situ, en los huertos familiares de las aldeas.

Un total de 1414 especies de plantas de Sri Lanka se consideran valiosas para la medicina autóctona (ayurvédica). De ellas, 50 son de uso intensivo, 208 son de uso común y 79 están amenazadas. Se ha llevado a cabo un proyecto para sentar las bases para la conservación y el uso sostenible de las plantas medicinales en Sri Lanka.

Estado de la recolección de germoplasma por grupo de cultivos en el PGRC

Grupo de cultivos	Número de accesiones en el PGRC
Arroz y especies afines	4999
Otros cereales y especies afines	1788
Legumbres de grano	2221
Hortalizas (legumbres, cucurbitáceas, brasicos, allium, verduras de hoja, etc.)	3164
Verduras y condimentos solanaces	1387
Cultivos frutales	165
Cultivos de raíces y tuberculos*	200
Cultivos oleaginosos	442
Plantas medicinales	30
Cultivos de fibras	67
Mostaza y especias afines	134