Информация о генетическом разнообразии естественной флоры и фауны Шри-Ланки крайне ограничена. Генетические ресурсы коренных растений Шри-Ланки находятся в природных экосистемах и разнообразных сельскохозяйственных системах страны. Генетическое разнообразие природной флоры является наименее документированным сегментом. Почти вся доступная информация ограничена экономически важными сельскохозяйственными культурами и их дикими родственниками.

Проведенные исследования генетического разнообразия леопардов указывают на меньшую генетическую изменчивость в популяциях Шри-Ланки по сравнению с популяциями полуостровной Малайзии. Молекулярный анализ показал, что шри-ланкийский леопард — это отдельный подвид, один из десяти видов в мире. У слонов Шри-Ланки относительно высокий уровень дифференциации мтДНК наблюдался в северных, средних широтах и южных районах острова.
Недавний молекулярный анализ показал, что прямые развивающиеся древесные лягушки рода Philautus (Rhacophoridae) представляют собой крупную эндемичную островную радиацию. Молекулярно-филогенетические исследования также показали, что цецилийская фауна Шри-Ланки имеет монофилетическое происхождение, а фауна юго-западных низменностей представляет собой кладу, которая, возможно, относительно недавно появилась в отличие от фауны центрального высокогорья.

Среди растений были проведены филогенетические и популяционно-генетические исследования некоторых представителей диптерокарповых (Shorea и эндемичный род Stemonoporus), Myrtaceae135 (Syzygium spp.) и Annonaceae (Polyalthia spp. и Xylopia champion). Показано, что доля общего генетического разнообразия популяций некоторых видов диптерокарпов в результате более высоких темпов их пересечения аналогична среднему показателю, зарегистрированному в литературе по тропическим древесным видам. Сообщалось о снижении внутрипопуляционной генетической изменчивости этих видов в вырубленных фрагментах лесов, что позволяет предположить, что деградация лесов, фрагментация и уменьшение размера среды обитания привели к их генетической эрозии.

Генетическое разнообразие диких родственников, традиционных сортов и видов сельскохозяйственных культур оценивается с точки зрения сохранения как на месте, так и на месте как в охраняемых районах, так и за их пределами, на сельскохозяйственных угодьях и приусадебных участках, в генетических банках, где это уместно, и характеризуется главным образом инициативами министерств сельского хозяйства и экспорта, а также научно-исследовательских институтов плантационных культур. Разнообразие генетических ресурсов сельскохозяйственных культур в различных агроэкологических регионах острова довольно велико. В Национальный гербарий в Перадении занесено в каталог около 645 видов сельскохозяйственных культур, диких родственников Шри-Ланки.

Разнообразие сельскохозяйственных растений острова включает в себя рис Oryza sativa с 2800 сортами/наземными расами и пятью дикими родственниками, 7 крупнозерных видов и их традиционных сортов кукурузы и сорго; 14 видов зерновых бобовых; 8 тыквенных, 2 одноцветных и 4 других вида овощей (фасоль, окра, амарант, чили); 17 видов корнеплодов и клубневых культур. К экономически полезным специям относятся 8 видов корицы, Elettaria cardamomum, 3 вида Piper (с 7 дикими родственниками), гвоздика, мускатный орех, орех бетель, ваниль, перец чили и имбирь. Другие важные виды напитков включают три основных вида напитков (чай, кофе и какао), сахарный тростник, китул, ареканут, тамаринд, цитронеллу, 3 вида масличных культур и 2 волокнистые культуры. К садоводческим сортам относятся бананы девяти сортов и два диких родственника, цитрусовые и более 20 других видов фруктов. Образцы зародышевой плазмы этого широкого спектра сельскохозяйственных культур хранятся в генетическом банке семян и полевых банках генов Министерства сельского хозяйства, а также на месте в сельских приусадебных садах.

Считается, что в общей сложности 1414 видов растений Шри-Ланки представляют ценность для местной (аюрведической) медицины. Из них 50 широко используются, 208 широко используются и 79 находятся под угрозой исчезновения. Реализован проект, призванный заложить основу для сохранения и устойчивого использования лекарственных растений в Шри-Ланке.

Состояние сбора зародышевой плазмы в разбивке по группам сельскохозяйственных культур в PGRC

Группа сельскохозяйственных культур	Количество присоединений в PGRC
Рис и родственные виды	4999
Другие злаки и родственные виды	1788
Зерновые бобовые	2221
Овощи (бобовые, тыквенные, капуста, лук, листовые овощи и т.д. )	3164
Соленые овощи и приправы	1387
Фруктовые культуры	165
Корневые и клубневые культуры*	200
Масличные культуры	442
Лекарственные растения	30
Волокнистые культуры	67
Горчица и родственные специи	134