Los murciélagos desempeñan funciones críticas en el ecosistema, incluida la polinización, la dispersión de semillas y la regulación de las poblaciones de invertebrados. Sin embargo, las poblaciones de murciélagos están disminuyendo en todo el mundo debido principalmente a la pérdida de hábitat y otros factores de estrés antropogénicos. Por lo tanto, los estudios sobre la ecología de los murciélagos, en particular sobre los determinantes ambientales de la ocupación de los murciélagos, son fundamentales para su conservación. La alta movilidad, el comportamiento nocturno y la selección de los lugares de descanso de los murciélagos dificultan los estudios convencionales. Además, se sabe poco sobre la distribución geográfica, la idoneidad del hábitat y las respuestas al cambio climático entre las especies de murciélagos tropicales. Para cerrar estas brechas de investigación, aplicamos modelos de nichos ecológicos a dos especies de murciélagos de Ceilán, Kerivoula malpasi y Kerivoula picta, para mapear su distribución geográfica. Las variaciones estacionales de temperatura y precipitación fueron predictores ambientales críticos de la distribución de los murciélagos en general. Los bosques de las tierras bajas del sudoeste contenían los hábitats más óptimos para la Kerivoula picta, de distribución relativamente amplia, mientras que las tierras altas centrales proporcionaron los hábitats más adecuados para la Kerivoula malpasi, de distribución estrecha. En respuesta al cambio climático previsto para ninguna de las especies, no se observaron cambios tangibles en los hábitats más adecuados. Sin embargo, las áreas de distribución óptimas de K. malpasi pueden fragmentarse en el futuro, mientras que los hábitats más óptimos para K. picta probablemente pasen a ser espacialmente contiguos en el futuro. La disponibilidad de hábitat o el nicho fundamental por sí solos son insuficientes para pronosticar de manera confiable la persistencia de las especies, por lo que advertimos que no debemos considerar que estas dos especies de murciélagos son resilientes al cambio climático. Nuestros hallazgos permitirán a las autoridades de conservación iniciar estrategias de conservación preventivas, como el establecimiento de una conectividad entre los hábitats a escala paisajística y la gestión de las zonas de amortiguamiento alrededor de las tierras de conservación. También alentamos a las autoridades de conservación a que empleen modelos de nichos ecológicos para cartografiar las posibles distribuciones de las especies y pronosticar los cambios de distribución debidos al cambio climático.